En 1922, la capital de Santa Catarina, Florianópolis, fue la elegida para albergar las instalaciones del sistema de defensa aérea del litoral de Brasil. En el año siguiente (1923) comenzaron las obras en el campo Ressacada para construir el Centro de Aviación Naval de Santa Catarina. El Ministerio de Aeronáutica inauguró en el año 1955 una terminal de pasajeros bajo la administración del Departamento de Aviación Civil. Entre otras instalaciones, existía una torre de control, pista de estacionamiento y una pista compartida con la Base Aérea de Florianópolis, que se mantienen hasta el día de hoy. En 1974, la empresa estatal Infraero recibió la jurisdicción sobre el aeropuerto. En los años siguientes fueron inaugurados una terminal de cargas y una nueva terminal de pasajeros. La pista principal 14/32, de 2,300 x 45 metros fue abierta al tráfico público en 1978. En la década de 1980 se realizaron una serie de mejoras en la infraestructura aeroportuaria de Florianópolis. En 1995, el Aeropuerto Internacional Hercílio Luz fue elevado a la categoría de internacional. Desde el 3 de enero de 2018, el Aeropuerto es administrado por Floripa Airport, una empresa del grupo Zurich Airport Brasil, de Suiza, ganadora de la subasta realizada el 16 de marzo de 2017. En el 1 de octubre de 2019, se modernizó el aeropuerto con un nuevo terminal de pasajeros y estacionamentos, nuevas pistas de rodajes y la ampliación de la pista principal 14-32 hacia 2,400m.