En 1916, comenzó la construcción del aeropuerto, y se concluyó en 1917. Las operaciones de la base área de Lübeck comenzaron poco después de su conclusión. Con el final de la Primera Guerra Mundial la base aérea fue cerrada. En 1933, el aeropuerto fue reabierto y la base aérea volvió a iniciarse con un mayor número de aeronaves Durante el Bloqueo de Berlín la Real Fuerza Aérea británica efectuó vuelos con DC 3 Dakota para abastecer a Berlín y refugiados al oeste de Alemania. Tras la reunificación de Alemania, el aeropuerto comenzó a crecer fuertemente. Un gran número de aerolíneas comenzaron a volar desde Lúbeck-Blankensee. En 1997, la terminal de llegadas fue remodelada y ampliada. Ryanair comenzó sus operaciones en 2000 con su primer vuelo a Londres-Stansted. Desde entonces, Ryanair amplió sus rutas con vuelos a Palma de Mallorca, Alicante, y Alghero en 2009, y posteriormente a Milán-Bergamo, Barcelona-Gerona, Dublín, Edimburgo, Pisa, Estocolmo-Skavsta y Fráncfort del Meno-Hahn en 2011. Infratil compró el 90% del aeropuerto en noviembre de 2005, y planeó recuperar su inversión a finales de octubre de 2009. Ryanair se encuentra en negociaciones para abrir una base en el horarios de vuelos del horario de invierno 2009/2010.